南光太郎和秋月信彦在一个日食的日子出生、并且以兄弟的身份被扶养长大。信彦的父亲，秋月总一郎是秘密组织戈鲁戈姆的成员之一。在光太郎和信彦19岁生日那天，两人被这个秘密组织捉去改造成为戈鲁戈姆的支配者

　在一次战斗后，光太郎发现自己变回了BLACK，而且三神官也出现在自己的面前。原来，克莱西斯帝国为了消灭BLACK RX，便想办法让RX变回以前力量不怎么强大的BLACK，并借机消灭他。